ISO28000認證是國際標準化組織針對供應鏈安全制定的標準，AEO認證則是WCO和各國海關組織制定和推行的認證經營者的標準。

AEO認證的申請者是所有參與國際供應鏈各環(huán)節(jié)且有獨立法人資格的實體。從這一點來說，AEO認證是有一定申請門檻的，認證時間相對會比較長。目前我國的AEO認證比較適合有一定的進出口量且進出口作業(yè)比較復雜，有明確的海關利害需求，需要規(guī)范關務有關的作業(yè)，存在一定的海關管控風險并有可能加劇，以及國外客戶有指定需求的企業(yè)。

而ISO 28000可以作為企業(yè)結合政府及海關安全要求提供認證的平臺， 建制系統(tǒng)完成后，不論各國海關或各國客戶采用怎樣的安全要求及規(guī)范，都可整合納入系統(tǒng)中運作，節(jié)省因滿足不同安全要求而花費的成本。因此，相對來說，ISO28000認證現(xiàn)階段適合的企業(yè)范圍更大，不論大小企業(yè)、是否法人單位，都適用。

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